根據數據，95%的客戶需求的工控機是要求安裝微軟系統，也有3%一些客戶需求安裝安卓系統的。
從工控機的主板來說，目前熱門的是X86架構的，即是可以安裝微軟windows 7 /8 / 10系統或Linux系統。另外一個偏門一點的的是ARM架構的，即是可以安裝安卓系統或Linux系統的。
X86架構的工控機的發展時間久，現在大一點的工控機廠家基本還在延續著去生產研發這個系統的。技術方面來說成熟一點。
ARM架構的工控產品是最近十幾年慢慢興起的，跟X86比起來，功耗要低很多。但是技術方面的成熟度比不上X86。
從性能說來說，微軟系統的工控機性能強悍。
X86結構的工控機無論如何都比ARM結構的工控機系統在性能方面要快得多、強得多。X86的CPU隨便就是1G以上、雙核、四核大行其道，通常使用45nm（甚至更高級）制程的工藝進行生產。而ARM架構的工控機，CPU通常是幾百兆，最近才出現1G左右的CPU，制程通常使用不到65nm制程的工藝，可以說在性能和生產工藝方面ARM根本不是X86結構系統的對手。
從擴展能力來說，微軟系統的工控機具備多種擴展方式。
X86架構的工控機采用“橋”的方式與擴展設備（如：硬盤、內存等）進行連接，而且x86結構的電腦出現了近30年，其配套擴展的設備種類多、價格也比較便宜，所以x86結構的電腦能很容易進行性能擴展，如增加內存、硬盤等。
從系統來說，微軟系統歷史悠久，用戶群大，易于開發軟件。
X86系統由微軟及Intel構建的Wintel聯盟一統天下，壟斷了個人電腦操作系統近30年，形成巨大的用戶群，也深深固化了眾多用戶的使用習慣，同時x86系統在硬件和軟件開發方面已經形成統一的標準，幾乎所有x86硬件平臺都可以直接使用微軟的視窗系統及現在流行的幾乎所有工具軟件，所以x86系統在兼容性方面具有無可比擬的優勢。
所以目前市場上主流的工控機都是采用微軟系統的。