《電子技術應用》
您所在的位置:首頁 > 模拟设计 > 业界动态 > FPGA在实时基因组测序计算大显身手,把测序时间从30小时缩短到26分钟!

FPGA在实时基因组测序计算大显身手,把测序时间从30小时缩短到26分钟!

2017-03-14

基因組測序是一種新型基因檢測技術,它可以從血液或者唾液中分析測定基因全序列,用來預測疾病,個人的行為特征等等。實現這一項技術需要海量的計算支持,常常需要等待一段時間才可以獲得檢測結果。然而,Edico Genome推出的“龍”硬件加速卡將測序計算時間由30小時縮短到26分鐘,很快就可能優化實現實時計算的目標。

IBM Power Systems最近在《華盛頓郵報》官網上發表了題為“Powerful computing crunches genomic data at warp speed”的文章,文章描述了Edico Genome使用硬件加速器來加速基因研究的海量計算。Edico Genome董事長兼CEO Pieter van Rooyen和他的團隊在南非進行血液分析的工作,主要面向兩種疾病:艾滋病(HIV)和肺結核(tuberculosis)。同時他們也開發了一款定制的硬件加速卡來加速計算,這款加速卡就是“龍”卡,卡上集成了基于IBM Power8處理器的S822LC高性能計算服務器和Xilinx28nm FPGA。

132630ktvqss0oznv898v4.jpg

加速卡計算的效果如何呢?“之前一個基因組測序需要大約30小時” van Rooyen說,“我們已經把計算時間降到26分鐘,很快,我們就會進一步優化到10分鐘”。他預計一個全序列基因編譯可以在接近實時的時間內完成。

視頻地址:http://static.video.qq.com/TPout ... 1p3d&auto=0

Stone在視頻中解釋說,FPGA加速卡將處理時間縮減到6分鐘左右,而純軟件處理大概需要6小時,FPGA硬件加速提供了約50X~60X的加速性能。目前Edico Genome“龍”卡上用的是Xilinx 28nm器件,公司已經考慮在他們下一代的板子上使用Xilinx UltraScale器件,在現有基礎上再獲得5X的加速性能提升。

歡迎分享本文,轉載請保留出處:http://www.eechina.com/thread-171408-1-1.html     【打印本頁】


本站內容除特別聲明的原創文章之外,轉載內容只為傳遞更多信息,并不代表本網站贊同其觀點。轉載的所有的文章、圖片、音/視頻文件等資料的版權歸版權所有權人所有。本站采用的非本站原創文章及圖片等內容無法一一聯系確認版權者。如涉及作品內容、版權和其它問題,請及時通過電子郵件或電話通知我們,以便迅速采取適當措施,避免給雙方造成不必要的經濟損失。聯系電話:010-82306118;郵箱:aet@chinaaet.com。
主站蜘蛛池模板: 伊人久久大香线蕉午夜av| 琪琪亚洲精品午夜在线| 日韩精品一区在线视频| 国产欧美亚洲精品| 久久伊人色综合| 欧美日韩国产91| 欧洲日本亚洲国产区| 亚洲日本一区二区三区在线不卡| 久久久成人av| 久久999免费视频| 国产专区欧美专区| 国产精品网站免费| 国产精品久久久久久av福利| 国产美女久久精品| 国产精品久久久久免费| 国产精品第一视频| av免费精品一区二区三区| 91国产一区在线| 色婷婷久久一区二区| 日韩一区国产在线观看| 欧美一级成年大片在线观看| 久久久久久综合网天天| 久久久中精品2020中文| 久久久免费视频网站| 国产日韩欧美91| aaa级精品久久久国产片| 亚洲 国产 日韩 综合一区| 亚洲欧美日韩精品久久久| 日韩av在线综合| 奇米影视亚洲狠狠色| 蜜臀精品一区二区| 国产三级精品网站| av免费观看网| 亚洲午夜精品一区二区| 欧美亚洲另类制服自拍| 国语精品免费视频| 91精品国产综合久久久久久久久| 日韩在线第三页| 日韩一级片一区二区| 欧美日韩亚洲一| 国产精品久久久久久久久久久久|