化合物中各原子團組合排列情況，是同紅外光譜中出現的特征官能團來確定的。

　　（1）溴化四氯化對位甲酚的結構，過往實驗以為它有三種可能的結構，但未能鑒別確定，現經過紅外光譜證實只有一種結構。

　　（2）二分子醛縮合醇酮，應為（I）式。若（I）式R換成吡啶基，則化學性質和（I）卻不相同了，它具有烯二醇式的反應如（II）式。可是在極烯的溶液中，也看不到自由羥基的3700cm（-1）-譜帶，卻在2750cm（-1）有締全氫鍵出現。可知它已形成了分子內氫鍵。

　　（I）羥酮式（II）烯二醇式

　　異構體的測定——可鑒定立體異構體和同分異構體（1）順反異體的測定——順反異構體原子團排列順序因無對稱中心，故C=C雙鍵在1630cm（-1），724cm（-1），而反式的C=C在較高頻率。

　　（2）同分異構體的鑒定——紅外光譜900～660cm（-1）區內可看到苯環取代位置不同的同分體。如二甲苯三個異構體的吸收譜帶很不相同。鄰位在742cm（-1），間位在770cm（-1），對位在800cm（-1），且因對二甲苯對稱性強，它的C=C雙鍵（苯骨架）在1500cm（-1）變小，并且600cm（-1）譜帶消失。

　　又如正丙基、異丙基、叔丁基由紅外光譜中的甲基彎曲振動可以看出。在1375cm（-1）只出現一個吸收帶，則表示為正丙基；若在1375cm（-1）出現相等強度的雙峰，則為異丙基；若在`1390cm（-1）及1365cm（-1）出現一強一弱譜帶，則為叔丁基。

　　乙醇和甲醚的分子式完全相同C2H6O，乙醇有羥基吸收帶在3500cm（-1），C-0伸縮振動在1050～1250cm（-1），羥基彎曲振動在950cm（-1）。甲醚在3500cm（-1）無羥基吸收。它的第一強1150～1250cm（-1），這兩個同分異構體很輕易區別。

　　化學反應的檢查——一個化學反應是否已進行完全，可用紅外光譜檢查，這是因原料和預期的產品都有其特征吸收帶。

　　例如氧化仲醇為酮時，原料仲醇的羥基吸收應消失，酮的羰基171cm（-1）應在產物中出現才反應進行完全。4.未知物剖析——可先將未知物分離提純，作元素分析，寫出分子式，計算不飽和度。從紅外光譜可得到此未知物主要官能團的信息，確定它是屬于哪種化合物。結合紫外、核磁等可鑒定此化合物的結構。